Agroseguro se encarga de la gestión de los seguros agrarios por cuenta y en nombre de las entidades aseguradoras que forman parte del pool de coaseguro. No es, por tanto, una entidad aseguradora, sino una entidad de gestión.

De acuerdo con ese objeto, sus principales actividades se concentran en la emisión de los recibos a los tomadores del seguro y la gestión de su cobro, la recepción de las declaraciones de siniestro de los asegurados y la realización de los trámites de peritación, valoración y pago de siniestros por cuenta de las coaseguradoras. Además, Agroseguro desarrolla estudios estadísticos e investigación actuarial en relación con la elaboración de las tarifas que se aplican a las diferentes líneas de seguro.

Adicionalmente, se encarga de la gestión del cobro de las subvenciones que corresponde satisfacer a la Entidad Estatal de Seguros Agrarios (ENESA) y a las diferentes comunidades autónomas, así como del pago de las primas por razón del reaseguro que presta el Consorcio de Compensación de Seguros. Asimismo, gestiona el reaseguro no cubierto por el mencionado organismo con compañías reaseguradoras del mercado internacional, realizándoles los pagos y cobros correspondientes por cuenta de aquellas entidades coaseguradoras que desean acogerse a este programa suplementario de reaseguro.

Finalmente, la Sociedad realiza trabajos complementarios al seguro agrario, como valoración o comprobación de cultivos, daños en cosechas por causas distintas a los riesgos cubiertos en el seguro, etc., por encargo de las administraciones públicas, y proporciona asistencia técnica en materia de organización y gestión de los seguros agrarios.